Evolution of resistance to sulfadoxine-pyrimethamine and chloroquine, and analysis of the complexity of Plasmodium falciparum infections, Welch (1897) in four localities in Côte d'Ivoire

Évolution des résistances à la sulfadoxine-pyriméthamine et à la chloroquine, et analyse de la complexité des infections à Plasmodium falciparum, Welch (1897) dans quatre localités en Côte d’Ivoire

Aristide Bérenger Ako Ako (1)

1 Institut Pasteur de Côte d'Ivoire

In Anonkoua-kouté, the frequencies of Plasmodium falciparum CQ and SP résistance conferring genotypes reached comparable levels between isolates from asymptomatic schoolchildren and those from symptomatic participants in 2008. However, differences in the proportions of AAKAA (35.7% among asymptomatic children) and SGKAA (32.3% in the symptomatic participants) genotypes were revealed. Likewise, among the symptomatic individuals living in Bonoua and Samo, comparable proportions were also determined despite different epidemiological patterns. Allelic diversity was greater in the rural area of Samo with several genotypes of which the double mutant FAKAS (3.3%), YAKAS (3.3%), or the triple mutant AGKAS (3.3%). In contrast, the allelic diversity of isolates from Bonoua was very limited with 4 genotypes associated with pfdhfr, three for pfdhps gene of which the mixed genotype SL-GKAA (58.5%) and the only pfcrt genotype CVIET (100%). Frequencies of IRNI, SGKAA and CVIET were higher in Anonkoua - Kouté (Abidjan) and Ayamé, while the CQ susceptible genotype CVMNK predominated in Dabakala. Within the years 2002 and 2008, various dynamics of alleles were found out in Anonkoua-Kouté. Prevalence increased (Cochrane- Armitage test, z > 0) for Asn-108 (p = 0.023) and Gly-437 (p = 0.028) allele. Opposite trends were determined (Cochrane- Armitage test, z < 0) for the sensitive alleles Ser -108 (p = 0.017) and Ala- 437 (p = 0.043). Similarly, a significant decrease (Cochrane- Armitage test, z < 0) of the prevalence of the NCSI (p < 0.0001) genotype was also found. A significant increase (Cochrane- Armitage test, z > 0) of AGKAA (p = 0.036, z > 0) was detected along with a significant drop in the prevalence of the sensitive SAKAA (p = 0.027, z < 0). Finally, the minimum number of parasites detected by infection rose from 3 to 2 clones between 2002 and 2008 in Anonkoua-Kouté.

À Anonkoua-kouté, les fréquences des génotypes de Plasmodium falciparum conférant la résistance à la SP et à la CQ ont atteint des niveaux comparables entre isolats d’écoliers asymptomatiques et ceux issus d’enfants symptomatiques en 2008. Les seules différences significatives ont concerné les génotypes AAKAA (35,7 % parmi les enfants asymptomatiques) et SGKAA (32,3 % au sein des participants symptomatiques). A Bonoua et Samo, des niveaux comparables de fréquences ont été aussi déterminés entre individus symptomatiques malgré la différence des faciès épidémiologiques. La diversité allélique a été plus grande dans la localité rurale de Samo avec plusieurs génotypes dont les doubles mutant FAKAS (3,3 %), YAKAS (3,3 %), ou le triple mutant AGKAS (3,3 %). Les isolats issus de Bonoua ont une diversité allélique très réduite avec 4 génotypes du gène pfdhfr, trois génotypes pour le gène pfdhps dont le mixte SL-GKAA (58,5 %), et le génotype CVIET (100 %) pour le gène pfcrt. Les fréquences des mutants IRNI, SGKAA et CVIET ont été plus élevées à Anonkoua-kouté et à Ayamé, tandis que le génotype sensible CVMNK a été prédominant à Dabakala. Au cours de la période 2002 à 2008, les prévalences ont augmenté à Anonkoua-kouté (Test de Cochrane-Armitage ; z > 0) pour les allèles Asn-108 (p = 0,023) et Gly-437 (p = 0,028).Des tendances contraires ont été mises en évidence (Test de Cochrane-Armitage ; z < 0) pour les allèles sensibles Ser-108 (p = 0,017) et Ala-437 (p = 0,043). De même, une baisse significative (Test de Cochrane- Armitage ; z < 0) de la prévalence du génotype NCSI (p < 0,0001) a été aussi mise en évidence. Une augmentation significative (Test de Cochrane-Armitage ; z > 0) des prévalences du génotype AGKAA (p = 0,036 ; z > 0) a été déterminée en même temps que la baisse significative du génotype sensible SAKAA (p = 0,027 ; z < 0). Enfin, le nombre minimum de parasites détectés par infection est passé de 3 à 2 clones entre 2002 et 2008 à Anonkoua-kouté.

Mots clés: Dynamics; prevalence; molecular markers; résistance; Plasmodium falciparum; sulfadoxine-pyrimethamine; chloroquine; pfdhps; pfdhfr; pfcrt; Côte d’Ivoire

Mots clés: Dynamique; taux de prévalence; marqueurs moléculaires; résistance; Plasmodium falciparum; sulfadoxine-pyrimethamine; chloroquine; pfdhps; pfdhfr; pfcrt; Côte d’Ivoire.

Domaines: Parasitologie; Génétique des populations [q-bio.PE]; Maladies infectieuses; Maladies émergentes

Aristide Bérenger Ako Ako. Évolution des résistances à la sulfadoxine-pyriméthamine et à la chloroquine, et analyse de la complexité des infections à Plasmodium falciparum, Welch (1897) dans quatre localités en Côte d’Ivoire. Parasitologie. Université Félix Houphouêt-Boigny Abidjan (Côte d'Ivoire), 2014. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-02885141⟩