CARACTERISATION MOLECULAIRE DE LA VIRULENCE ET DE LA RESISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES DE HELICOBACTER PYLORI DANS DES BIOPSIES GASTRIQUES HUMAINES EN CÔTE D'IVOIRE - Institut Pasteur de Côte d'Ivoire Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2017

MOLECULAR CHARACTERIZATION OF HELICOBACTER PYLORI VIRULENCE AND ANTIBIOTIC RESISTANCE IN HUMAN GASTRIC BIOPSIES IN CÔTE D'IVOIRE

CARACTERISATION MOLECULAIRE DE LA VIRULENCE ET DE LA RESISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES DE HELICOBACTER PYLORI DANS DES BIOPSIES GASTRIQUES HUMAINES EN CÔTE D'IVOIRE

Résumé

Helicobacter pylori infection (H. pylori) affects more than 50% of world's population and causes many severe gastroduodenal diseases such as peptic ulcers, MALT lymphoma and gastric cancer. Problem of H. pylori infection lies in resistance of bacterium to antibiotics used and its evolution towards cancer. This work focused on molecular characterization of H. pylori virulence and antibiotic resistance in chronic gastroduodenal infections. Polymerase Chain Reaction (PCR) methods and genetic sequencing allowed this study to be conducted. Study of genetic diversity of H. pylori virulence made it possible to describe a genotype profile s1a + / m1a + / cagA + / oipA + and tipA + involved in chronicity of infection and to suggest that presence of multiple genotypes would be necessary to colonization and persistence of H. pylori in the gastric mucosa. The results of search for antibiotic resistance genes used for treatment of H. pylori in Côte d'Ivoire, showed a high level of Amoxicillin resistance (58.2%) and presence of point mutations in genes conferring resistance to antibiotics used for treatment. However, no cross-resistance to clarithromycin and metronidazole combination was identified in this study. This could guide treatment protocol of H. pylori to priority combination of these two molecules (clarithromycin and metronidazole) in the Ivorian hospital context. Patients with H. pylori strains with antibiotic resistance genes predominantly had lesions characterized by inflammation and redness in gastric mucosa associated with presence and persistence of H. pylori. These results support the need for an evolution for current therapeutic protocol in Côte d'Ivoire. Results obtained in this study are essential. They serve as basis for better characterization of H. pylori infection and for effective management of emergence of gastroduodenal diseases related to this bacterium in Côte d'Ivoire.
L'infection à Helicobacter pylori (H. pylori) touche plus de 50% de la population mondiale et provoque de nombreuses pathologies gastroduodénales sévères telles que les ulcères gastroduodénaux, le lymphome du MALT et le cancer gastrique. La problématique de l'infection à H. pylori se situe au niveau de la résistance de la bactérie aux antibiotiques utilisés et de son évolution vers le cancer. Ce travail a porté sur la caractérisation moléculaire de la virulence et de la résistance aux antibiotiques de H. pylori dans les infections gastroduodénales chroniques .Les méthodes de réaction en chaine de la polymérase (PCR) et le séquençage génétique ont permis la réalisation de cette étude. L'étude de la diversité génétique de la virulence de H. pylori a permis de décrire un profil génotypique s1a+/m1a+/cagA+/oipA+ et tipA+ impliqués dans la chronicité de l'infection et de suggérer que la présence de multiples génotypes serait nécessaire à la colonisation et la persistance de H. pylori dans la muqueuse gastrique. Les résultats de la recherche des gènes de résistance aux antibiotiques utilisés pour le traitement de H. pylori en Côte d'Ivoire, ont montrés un niveau de résistance élevée de H. pylori (58,2% ) vis-à-vis de l’Amoxicilline et la présence de mutations ponctuelles dans les gènes conférant la résistance aux antibiotiques utilisés pour le traitement. Cependant, aucune résistance croisée au couple clarithromycine et métronidazole associé n'a été identifiée dans cette étude. Cela pourrait orienter le protocole du traitement de H. pylori vers l'association en priorité de ces deux molécules (clarithromycine et métronidazole) dans le contexte hospitalier ivoirien. Les patients dont les souches de H. pylori possédaient des gènes de résistance aux antibiotiques présentaient en majorité des lésions caractérisées par une inflammation et des rougeurs au niveau de la muqueuse gastrique liés à la présence et à la persistante de H. pylori. Ces résultats sont en faveur de la nécessité d’une évolution du protocole thérapeutique en vigueur en Côte d’Ivoire. Les résultats obtenus au cours de cette étude sont essentiels. Ils servent de base pour une meilleure caractérisation de l'infection à H. pylori et une gestion efficace de l'émergence des maladies gastroduodénales liées à cette bactérie en Côte d’Ivoire.
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  • HAL Id : tel-02526966 , version 1

Citer

Tchépé Flore Bernadette Diplo. CARACTERISATION MOLECULAIRE DE LA VIRULENCE ET DE LA RESISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES DE HELICOBACTER PYLORI DANS DES BIOPSIES GASTRIQUES HUMAINES EN CÔTE D'IVOIRE. Sciences du Vivant [q-bio]. Université Félix Houphouët-Boigny (Abidjan - Côte d'Ivoire); N°ORDRE 2069 / 2017, 2017. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-02526966⟩
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